Mulder a retrouvé sa sœur, kidnappée par des extraterrestres dans son enfance. Le chasseur de primes la recherche et piège Scully dans sa chambre d'hôtel en prenant l'apparence de Mulder. Il aurait pour mission de mettre fin à une colonie d'extraterrestres installée sur terre depuis 1940, en éliminant tous les clones qu'ils ont créés, dont Samantha est un des modèles originaux...
